Passando-se um ano antes da chegada dos Zentraedi à Terra, Macross Zero narra os últimos dias da guerra entre a U.N. Spacy e as facções anti-ONU. Depois de ser abatido pelo mais novo caça da anti-ONU, o piloto Shin Kudo se vê na remota ilha de Mayan, onde a tecnologia é quase inexistente. Enquanto Shin permanece na ilha para curar seus ferimentos, a tranquilidade do local é abalada por uma batalha que envolve o mais novo caça da ONU, o VF-0.
(Fonte: ANN)
